شبیه‌سازی دینامیک مولکولی

توضیحات خدمت

شبیه‌سازی دینامیک مولکولی پویایی اتمی سیستم را در مقیاس زمانی نانوثانیه تا میکروثانیه شبیه‌سازی میکند. ما سیستم را آماده میکنیم (حل، یون، pH)، مینیمایزیشن و تعادل اجرا میکنیم و سپس پرواز تولیدی انجام میشود. تحلیلها شامل RMSD، RMSF، شعاع چرخش، نقشه تعامل و انرژی است.

این خدمت شامل:

• آماده‌سازی سیستم (حل، یون، pH)
• مینیمایزیشن و تعادل
• پرواز تولیدی (۱۰۰ns یا بیشتر)
• تحلیل RMSD / RMSF / Rg
• نقشه تعامل و انرژی
• نمودارهای تحلیلی با کیفیت

مراحل کار

1. ارسال ساختار پروتئین
2. آماده‌سازی سیستم
3. تعادل و پرواز
4. تحلیل داده
5. تحویل گزارش + مسیرهای شبیه‌سازی