داکینگ مولکولی

توضیحات خدمت

داکینگ مولکولی برای غربالگری ترکیبات و درک تعامل لیگاند-گیرنده است. ما پروتئین و لیگاندها را آماده میکنیم (بهینهسازی، تعیین بار و پروتوناسیون)، محل اتصال را تعریف میکنیم و غربالگری مجازی یا داکینگ تک ترکیب اجرا میشود. خروجی شامل رتبهبندی ترکیبات، تحلیل تعاملهای هیدروژنی و هیدروفوبیک و رندر سهبعدی کمپلکس است.

این خدمت شامل:

• آماده‌سازی گیرنده و لیگاند
• تعریف محل اتصال (grid)
• غربالگری مجازی کتابخانه
• رتبه‌بندی بر اساس نمره اتصال
• تحلیل تعامل‌ها (هیدروژنی/هیدروفوب)
• رندر سه‌بعدی کمپلکس

مراحل کار

1. ارسال ساختار پروتئین و لیگاندها
2. آماده‌سازی و اعتبارسنجی
3. داکینگ / غربالگری
4. تحلیل و رتبه‌بندی
5. تحویل گزارش + رندر